Инстурменты:
Инструментов для ведения заметок в Zettlekasten много, начиная от просто бумажных карточек как в оригинальной методике Лумана. В принципе подойдёт любой инструмент поддерживающий теги и ссылки между заметками.
Но есть инструменты поудобнее, специально заточенные под Zettelkasten или же достаточно навороченные штуки, которые можно под него приспособить. Например, сейчас становится популярным Roam Research — онлайн сервис для ведения текстов, очень интересные, рекомендую попробовать.

• Просто бумажные карточки и ручка
  
• Сервисы вроде Wiki, Evernote
  
• Connected Text
  
• Workflowy
  
• Roam Research
  
• Zettelkasten
  
• Zettlr
  
• Emacs + Zetteldeft
  
• Obsidian
  
• Foam — набор плагинов для VS Code
  
• Плагин для Sublime Text
  
• nVALT
  
• The Archive
  
• The Brain для Windows
  
  

Лично я пробовал почти их все в итоге остановился:

• IA Writer на мобильных
  
• The Archive, чтобы быстро добавлять заметки на Маке
  
• VS Code Foam — для вдумчивой работы над заметками (аналог — Obsidian)